Jurusan Biologi merupakan salah satu jurusan tertua dan memiliki peran sentral dalam pengembangan ilmu pengetahuan alam di Universitas Negeri Manado (UNIMA). Sejarah panjang jurusan ini bermula sejak didirikannya Perguruan Tinggi Pendidikan Guru (PTPG) Tondano pada tanggal 22 September 1955, berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan, Pengajaran dan Kebudayaan Republik Indonesia Nomor 24511/Kab/1955. Pada masa awal berdirinya, PTPG Tondano membina 17 jurusan, termasuk empat jurusan di bidang Ilmu Pengetahuan Alam, salah satunya adalah Jurusan Biologi, yang saat itu dikenal dengan nama Jurusan Ilmu Hayat, dipimpin oleh Dr. J.A. Kaligis.

Seiring dinamika perubahan kelembagaan nasional, PTPG Tondano mengalami transformasi menjadi Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) Universitas Hasanuddin (UNHAS) pada tahun 1957, dan berkedudukan di Tondano. Pada tahun 1958, FKIP UNHAS dipindahkan ke Manado. Di masa ini, Jurusan Ilmu Hayat tetap aktif dengan kepemimpinan yang berlanjut hingga tahun 1964. Perubahan kelembagaan terus berlanjut, di antaranya menjadi FKIP SULUTENG pada tahun 1961, lalu menjadi IKIP Yogyakarta cabang Manado pada tahun 1963. Pada periode ini, jurusan-jurusan dalam rumpun Ilmu Pengetahuan Alam, termasuk Biologi, dibina oleh Fakultas Keguruan dan Ilmu Eksakta (FKIE).

Tahun 1965 menjadi tonggak penting dalam sejarah institusi, saat IKIP Yogyakarta cabang Manado berubah status menjadi IKIP Negeri Manado berdasarkan SK Menteri PTIP Nomor 55 Tahun 1965. Jurusan Biologi tetap berada dalam naungan FKIE yang membina lima fakultas keguruan pada masa itu. Dalam kurun waktu ini, FKIE terus mengalami perkembangan baik dari segi kepemimpinan, struktur akademik, maupun peningkatan mutu pendidikan.

Transformasi nomenklatur kelembagaan kembali terjadi pada tahun 1982, dengan dikeluarkannya Keputusan Presiden Nomor 71 Tahun 1982 dan Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 0157/O/1983. FKIE resmi berganti nama menjadi Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FPMIPA). Jurusan Biologi pun semakin memperkuat posisinya sebagai pilar utama dalam pengembangan pendidikan sains di lingkungan fakultas.

Puncak dari perkembangan kelembagaan terjadi pada tahun 2000, ketika IKIP Negeri Manado berubah status menjadi universitas, dan resmi menjadi Universitas Negeri Manado (UNIMA) melalui Keputusan Presiden RI Nomor 127 Tahun 2000. Sebagai konsekuensi dari perubahan tersebut, FPMIPA berganti nama menjadi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA). Jurusan Biologi kemudian membina dua program studi, yaitu:

• Program Studi Pendidikan Biologi, yang fokus pada pengembangan calon pendidik dan tenaga kependidikan di bidang biologi,

• Program Studi Ilmu Biologi, yang fokus pada penguasaan dan pengembangan ilmu murni Biologi.

Kedua program studi ini terus dikembangkan untuk menjawab tuntutan pendidikan tinggi yang berorientasi pada mutu, riset, dan pengabdian masyarakat, sejalan dengan visi FMIPA dan Universitas Negeri Manado dalam mencetak lulusan yang unggul, inovatif, dan kompetitif di tingkat nasional maupun global.

Hingga saat ini, Jurusan Biologi FMIPA UNIMA tetap berkomitmen dalam mengembangkan pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat yang berorientasi pada kelestarian lingkungan, biodiversitas, serta kemajuan ilmu pengetahuan dan teknologi berbasis kearifan lokal.