Laboratorium Mikrobiologi merupakan salah satu fasilitas utama di Jurusan Biologi Universitas Negeri Manado yang digunakan untuk menunjang kegiatan praktikum dan penelitian di bidang mikroorganisme. Laboratorium ini dirancang untuk memperkenalkan mahasiswa pada teknik dasar dan lanjutan dalam mengisolasi, mengamati, mengidentifikasi, serta membudidayakan berbagai jenis mikroba seperti bakteri, kapang, dan khamir yang berperan penting dalam kehidupan maupun lingkungan.

Tujuan penggunaan laboratorium ini adalah untuk memberikan pemahaman konseptual dan keterampilan praktis kepada mahasiswa dalam bidang mikrobiologi, baik untuk kepentingan akademik, penelitian, maupun pengembangan bioteknologi. Mahasiswa dibekali dengan keterampilan aseptis, teknik kultur mikroba, serta metode identifikasi mikroorganisme menggunakan media dan alat laboratorium secara tepat dan aman.

Laboratorium Mikrobiologi dilengkapi dengan berbagai alat dan bahan penunjang, antara lain laminar air flow, autoklaf, inkubator, mikroskop cahaya, mikropipet, spiritus burner, serta media tanam seperti NA (Nutrient Agar), PDA (Potato Dextrose Agar), dan berbagai reagen pewarnaan. Tersedia juga koleksi kultur mikroorganisme yang digunakan untuk kegiatan praktikum dan penelitian dasar.

Mata kuliah yang dilayani oleh laboratorium ini meliputi Mikrobiologi, dan Bioteknologi. Laboratorium ini berperan penting dalam membekali mahasiswa dengan keterampilan laboratorium mikrobiologi yang aplikatif, serta mendorong kegiatan riset di bidang kesehatan, pertanian, dan lingkungan berbasis mikroorganisme.